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“超级生命计算机”——全球日生产能力最强基因测序仪在深发布
发布日期:2019-09-20 02:29   来源:未知   阅读:

  2018年10月25日,全球最具影响力的集基因组学研究和产业应用于一体的国际交流峰会——第十三届国际基因组学大会(International Conference on Genomics,以下简称“ICG-13”)在深圳举行。

  开幕式上,“超级生命计算机” ——MGISEQ-T7的发布引人注目,这台由华大集团旗下子公司——华大智造自主研发的最新超高通量的基因测序仪一天就可以完成60例个人全基因组测序,日产出数据高达6Tb,是目前全球日生产能力最强的基因测序仪。

  基因是生命的密码,国家级人群基因组学研究以及对遗传资源的保护与应用是精准医学的基础,直接影响到一个国家在生物医药领域的核心竞争力。因此,自国际人类基因组计划之后,各国纷纷推出国家级大规模人群基因组测序项目。

  近日,华大在国际权威学术杂志《细胞》上发布了最大规模中国人基因组学大数据研究成果,这标志着我国已迈出“百万人群基因大数据研究”的重要一步。几乎同一时间,英国政府再次宣布将在未来五年内开展500万人基因组计划。

  然而,由于受到设备数量、速度和成本等现实原因的制约,基因组的测序效率在前几年推进并不顺利。以英国为例,2012年12月,英国启动十万人基因组计划,一直到2018年7月,花了5年半的时间才完成7万多例全基因组测序。

  据了解,本次发布的全新超高通量基因测序仪——“MGISEQ-T7”,将彻底改变目前现状。日产出数据高达6Tb,意味着一天就可以完成60例个人全基因组测序。以前,十万人级别的基因组测序可能需要4到6年的时间才能完成,现在,仅需6台该测序仪,一年时间即可完成,这将对目前测序产业的发展起到强有力的推动作用,也标志着基于基因检测的精准医学研究全面进入大数据时代成为可能。

  目前,市场上所有的测序仪最多只能支持两张芯片同时运行,而T7的4联芯片平台采用独特的芯片搭载技术,可实现4张芯片进行完全独立的测序流程,如同4台测序仪同时进行工作,且芯片间互不影响。

  同时,MGISEQ-T7可同时支持全基因组测序、超深度外显子测序、表观基因组测序、肿瘤大Panel基因检测。也就是说,用户可以按照他们的不同需求随时随地进行同时测序,并可以最大程度节省时间。

  测序仪运行速度的快慢将直接影响到测序项目的交付时间,因此,业界始终致力于提升测序仪的运行速度。研发团队通过全面升级生化系统、光学系统,并将图像数据处理速度提升15倍,从而使得MGISEQ-T7测序速度提升到行业最高水平的50%以上,远远领先于其他测序仪,仅需不到24小时便可完成PE150。

  据了解,测序仪芯片密度越高,意味着可产出更多的有效数据量。MGISEQ-T7将原有的芯片密度提高了20%,使得单张芯片即可实现Tb级数据产出。加之4张芯片可同时独立运行,24小时无休轮转,福建省局制订专卖管理力戒形式主义、克服官僚。MGISEQ-T7每天最多可产出6Tb数据,真正实现强大日生产能力。

  此外,针对基因测序特殊的要求,华大智造研发出自动化样本制备系统MGISP-960,单次最多可自动完成96个样本的制备,支撑了MGISEQ-T7测序通量需求,让MGISEQ-T7的强大性能得以更充分的体现。

  与此同时,华大智造还将在ICG-13的同期卫星会上发布最新建库技术stLFR和生信分析加速产品MegaBOLT。例如肿瘤数据的分析较常规数据更为耗时,而使用MegaBOLT,可以带来15倍以上计算速度的提升,从源头上大幅促进肿瘤研究的进程。同时,MegaBOLT也将上线BGI Online云计算平台,为接下来的基因数据的分析提供了更加灵活高效的解决方案。

  9月18日,在位于纽约的联合国总部,联合国秘书长古特雷斯出席记者会。联合国秘书长古特雷斯18日表示,第74届联合国大会期间,各国领导人或高级代表将在纽约联合国总部就人类共同面临的重大威胁与挑战商讨应对之策。新华社记者 李木子 摄9月18日,在位于纽约的联合国总部,联合国秘书长古特雷斯出席记者会。

  9月17日,安徽省肥西县金牛蚕桑农民专业合作社的农民在整理蚕茧。新华社记者刘军喜摄9月17日,安徽省肥西县金牛蚕桑农民专业合作社的农民为蚕添加桑叶。新华社记者刘军喜摄9月17日,安徽省肥西县金牛蚕桑农民专业合作社的农民在整理蚕茧。

  9月17日,果农在河北省清河县葛仙庄镇花园村采摘山楂。近年来,当地在引导农民集中连片发展无公害山楂种植的同时,积极推动农旅融合,带动了13个村2100余户种植户致富增收。近年来,当地在引导农民集中连片发展无公害山楂种植的同时,积极推动农旅融合,带动了13个村2100余户种植户致富增收。

  9月17日,广西都安瑶族自治县密洛陀文化公园广场,演员在启动仪式上表演节目《在希望的田野上》。当日,2019年广西庆祝“中国农民丰收节”启动仪式暨河池市“庆丰收·促脱贫”系列活动在都安瑶族自治县举行,各族群众和来宾一起载歌载舞欢庆丰收节。

  9月17日,河北省唐山市丰润区宇轩农产品农民专业合作社员工在晾晒核桃(无人机拍摄)。近日,河北省唐山市丰润区核桃喜获丰收,近10万亩优质核桃陆续下树,销往全国各地市场。近日,河北省唐山市丰润区核桃喜获丰收,近10万亩优质核桃陆续下树,销往全国各地市场。

  这是位于湖北省红安县七里坪镇的长胜街(8月2日摄)。新华社记者 程敏 摄农民在湖北红安县一处红薯田进行除草作业(2018年6月27日无人机拍摄)。

  9月17日,河北省内丘县实验小学学生在邢瓷文化体验馆内参观。学生们来到内丘“邢窑三馆”——中国邢窑博物馆、邢窑遗址博物馆、邢瓷文化体验馆,参观邢白瓷藏品,学习邢白瓷知识,感受家乡邢窑文化。

  当日,“发现‘中纹’之美——首届中华符号数字化创意设计大赛”颁奖仪式在北京故宫博物院举行。本次大赛于3月28日启动,分为“中华符号全国征集大赛”和“中华符号创意设计大赛”两个阶段,最终评选出优胜作品33份,其中图形图案类17份,办公应用类7份,创意字体类9份。

  这是9月17日无人机拍摄的贵州省榕江县计划乡计划村阳开苗寨梯田。近日,贵州省黔东南苗族侗族自治州榕江县计划乡计划村阳开苗寨的水稻陆续成熟,农民们抢抓农时收割稻谷。从空中俯瞰,层层叠叠的梯田线条分明,与古朴的苗寨木楼相互映衬,美不胜收。

  2019年8月30日,“赵继宗院士西藏神经外科技术指导中心”在西藏自治区第二人民医院成立,181678.com主办方VentureBeat还特。以西藏自治区第二人民医院为支点,辐射促进西藏全区神经外科发展。 新华社记者 晋美多吉 摄9月17日,西藏自治区第二人民医院的医生通过直播视频观摩赵继宗院士脑动脉肿瘤手术示范。

  《祖国畅想曲》由于京君作曲,浙江交响乐团演出,分为《光辉历程》《绿水青山》《民族团结》《走向未来》4个乐章。《祖国畅想曲》由于京君作曲,浙江交响乐团演出,分为《光辉历程》《绿水青山》《民族团结》《走向未来》4个乐章。

  非洲多国及非盟驻华外交官参访新疆:积极评价去极端化举措 赞赏社会和谐发展

  津巴布韦驻华使馆参赞阮葛芮莱·穆咋普(左二)与吐鲁番市高昌区职业技能教育培训中心学员(右二)交流培训学习情况(9月10日摄)。”两位非洲国家及非盟驻华外交官与乌鲁木齐市固原巷社区“社区家庭”(托儿所)的小朋友们亲切握手(9月9日摄)。

  9月17日,村民在采摘成熟的食用菌。内蒙古呼伦贝尔市莫力达瓦达斡尔族自治旗尼尔基镇丰华村建立食用菌基地,大力发展滑子蘑、平菇、猴头菇等菌类产业。内蒙古呼伦贝尔市莫力达瓦达斡尔族自治旗尼尔基镇丰华村建立食用菌基地,大力发展滑子蘑、平菇、猴头菇等菌类产业。

  9月17日,在巴基斯坦首都伊斯兰堡,来自巴基斯坦剑桥学校的学生表演歌舞《友谊》。由巴基斯坦中国文化中心和全巴基斯坦—中国友好协会联合主办的巴基斯坦学生诗歌、作文与对话比赛颁奖仪式当天在巴基斯坦首都伊斯兰堡举行。

  9月17日,在阿富汗东部帕尔万省,警察在查看爆炸现场。当天早些时候,阿东部帕尔万省举行的一场总统竞选集会活动遭炸弹袭击,造成24人死亡、32人受伤。当天早些时候,阿东部帕尔万省举行的一场总统竞选集会活动遭炸弹袭击,造成24人死亡、32人受伤。

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